Le meilleur logiciel de facturation pour auto-entrepreneur en 2026

Un auto-entrepreneur n’a pas besoin d’un outil de gestion complet : il lui faut émettre des factures conformes, recevoir celles de ses fournisseurs, et ne pas y passer ses soirées. Plusieurs solutions gratuites suffisent — à condition qu’elles soient réellement agréées.

Tarifs relevés le 4 août 2026 · agrément vérifié sur la liste officielle DGFiP

Notre classement

Numéro 1 : PennylaneOffre gratuite
Offre gratuite et agrément en nom propre
7 €
HT / mois
Pennylane s’est imposé comme la plateforme de référence des cabinets d’expertise comptable français. Son principal atout vient de là : quand votre cabinet y tient déjà votre comptabilité, la facturation électronique s’active dans le même environnement, sans passerelle ni double saisie.
Note
8,9 / 10
Formats
Les 3
Volume inclus
1 200 factures / an
Statut
Plateforme agréée
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Numéro 2 : Qonto
Les trois formats, agrément en nom propre
9 €
HT / mois
L’argument de Qonto est unique dans ce panel : le compte bancaire professionnel et la facturation vivent dans le même outil. Une facture émise est rapprochée de son encaissement sans import ni export, ce qui supprime une étape entière du suivi client.
Note
8,4 / 10
Formats
Les 3
Volume inclus
Selon offre
Statut
Plateforme agréée
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Numéro 3 : IndyOffre gratuite
Offre gratuite et agrément en nom propre
9 €
HT / mois
Indy propose l’une des offres gratuites les plus complètes du marché : facturation électronique, devis et factures illimités, comptabilité automatisée et compte professionnel optionnel, sans limite de volume. Pour un indépendant dont le besoin se résume à être en conformité, c’est difficile à battre.
Note
8,3 / 10
Formats
Factur-X, UBL
Volume inclus
Devis et factures illimités
Statut
Plateforme agréée
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Numéro 4 : TiimeOffre gratuite
Offre gratuite et agrément en nom propre
17,99 €
HT / mois
Tiime a construit son produit autour de la relation entre l’indépendant et son cabinet, avec un réseau de plusieurs milliers de cabinets partenaires. Les pièces remontent au comptable avec un niveau de préparation qui limite les allers-retours de fin de mois.
Note
8,2 / 10
Formats
Factur-X, UBL
Volume inclus
Factures et devis illimités
Statut
Plateforme agréée
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Numéro 5 : AbbyOffre gratuite
Offre gratuite et agrément en nom propre
9 €
HT / mois
Abby cible exclusivement les micro-entrepreneurs, et cette spécialisation se voit partout : estimation des cotisations URSSAF, alertes sur les seuils de TVA, livre des recettes. L’interface parle le vocabulaire du régime micro plutôt que celui de la comptabilité générale.
Note
8,0 / 10
Formats
Factur-X, UBL
Volume inclus
Devis et factures illimités
Statut
Plateforme agréée
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Classement établi sur la note éditoriale, le statut au regard de la réforme, la couverture des formats et l’accessibilité tarifaire. Notre rémunération n’entre pas dans ce calcul. Comment nous classons

Ce qui compte vraiment pour ce profil

L’agrément avant tout

Un logiciel gratuit qui n’est pas relié à une plateforme agréée ne vous met pas en conformité. C’est le premier filtre, avant même le prix.

Le suivi des seuils

En micro-entreprise, dépasser un seuil de chiffre d’affaires change votre régime. Les outils spécialisés vous alertent avant, pas après.

Le coût réel

Plusieurs offres gratuites couvrent la facturation électronique sans limite de volume. Payer n’a de sens que si vous avez besoin des déclarations ou des relances.

Questions fréquentes

Un auto-entrepreneur en franchise de TVA est-il concerné par la réforme ?

Oui. Le régime de TVA ne change rien : être en franchise signifie que vous ne collectez pas la taxe, pas que vous sortez du champ de la réforme. Vous restez assujetti, donc concerné par la réception dès septembre 2026 et par l’émission en septembre 2027.

Un logiciel gratuit peut-il vraiment suffire ?

Oui, si votre besoin se limite à émettre et recevoir des factures conformes. Plusieurs plateformes agréées proposent un palier gratuit sans limite de volume. Les fonctions payantes concernent les déclarations fiscales, les relances et les intégrations comptables.

Puis-je continuer à envoyer mes factures en PDF par email ?

Jusqu’en septembre 2027 pour vos émissions, oui. Après, non : un PDF envoyé par email n’est pas une facture électronique au sens de la réforme. Il faut des données structurées transmises par une plateforme agréée.

Je ne facture que des particuliers, suis-je concerné ?

Vos ventes aux particuliers ne relèvent pas de la facturation électronique mais de l’e-reporting : vous devrez transmettre périodiquement les données de ces transactions. Et vous devez pouvoir recevoir les factures de vos fournisseurs dès septembre 2026.

Affiner selon vos critères

Le comparateur filtre l’ensemble des plateformes sur votre volume de factures, les formats acceptés et votre logiciel de comptabilité.

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